Rasio kurang saka A260 / A230 biasane disebabake impurities karo dawa gelombang panyerepan maksimum ing 230nm.Ayo ndeleng apa sing kalebu impurities:
-
polutan umum
Dawane gelombang penyerapan
Efek rasio
Protein
~ 230nm lan 280nm
Pengurangan simultan A260/A 280lan A260/A 280rasio
uyah guanidine
220-240 nm
Ngurangi A260/A 280rasio
fenol
~270nm
-
Trizol
~ 230nm lan 270nm
Ngurangi A260/A 280rasio
EDTA
~230nm
Ngurangi A260/A 280rasio
Etanol
230-240 nm
Ngurangi A260/A 280rasio
Dawane gelombang penyerapan lan nilai kontras polutan umum
Pkontaminasi rotein
Polusi protein bisa dianggep minangka polusi sing paling umum ing proses ekstraksi asam nukleat.Protein ana ing antarane fase banyu ndhuwur lan ngisororganikurutane .Polusi bakal nyuda rasio A260 / A280 lan A260 / A230 ing wektu sing padha, lan rasio A260 / A230 bakal luwih jelas tinimbang rasio A260 / A280.
Sajrone sakterusetranskripsi mbalikkeor reaksi qPCR, residu protein bisa nyandhet utawa ngganggu fungsi enzim.Cara paling apik kanggo ngindhari kontaminasi protein yaiku ngelingi prinsip "luwih sithik tinimbang luwih akeh, jumlah cilik kaping pirang-pirang" nalika nyedhot supernatan.
2. polusi guanidinium
hidroklorida (GuHCl) lan guanidine thiocyanate (GTC) duweni efek denaturasi protein, sing bisa ngrusak membran sel kanthi cepet sajrone proses ekstraksi asam nukleat, nyebabake denaturasi lan presipitasi protein.Dawane gelombang penyerapan GuHCl lan GTC antara 220-240 nm, lanuyah guanidinium residual bakal nyuda rasio A260 / A230.Senajan uyah guanidinium residual bakal ngurangi rasio,impact ing nyobi hilir bener dijarno.
3. kontaminasi Trizol
Komponen utama Trizol yaiku fenol.Fungsi utama fenol yaiku lyse sel lan ngeculake protein lan zat asam nukleat ing sel.Senadyan fénol bisa èfèktif denaturasi protein, iku ora bisa rampung nyandhet aktivitas RNase.Mulane, 8-hydroxyquinoline, guanidine isothiocyanate, β-mercaptoethanol, lan liya-liyane ditambahake ing TRIzol kanggo nyegah RNase endogen lan eksogen.
Nalika ngekstrak RNA seluler, Trizol bisa kanthi cepet lyse sel lan nyandhet nuklease dirilis saka sel, lan Trizol ampas bakal Ngartekno nyuda rasio A260/A230.
Cara pangolahan: Nalika centrifuging, kudu dicathet yen fenol ing Trizol gampang larut ing fase banyu ing kondisi 4 ° lan suhu kamar.
4. Sisa etanol
Etanol digunakake ing proses pungkasan kanggo precipitate DNA nalika larut ion uyah sing bisa kaiket ing DNA.Dawane gelombang panyerepan sing paling dhuwurpuncak panyerepan sakaetanol uga ing 230-240 nm, kanguga bakal ngurangi rasio A260/A230.
Cara nyingkiri residu etanol bisa diulang kaping pindho sajrone elusi pungkasan, ndamu ingtudung asapsuwene rong menit supaya etanol bisa nguap kanthi lengkap sadurunge ditambahake buffer kanggo elusi.
Nanging, kudu dingerteni yen rasio kasebut mung minangka indeks evaluasi kualitas RNA.Yen operasi sing kasebut ing ndhuwur diatur kanthi ketat, panyimpangan antarane rasio lan kisaran standar ora bakal duwe pengaruh gedhe ing eksperimen hilir.
Produk sing gegandhengan:
Kit Isolasi RNA Total Hewan
Kit Isolasi RNA Total Tanaman
Kit Isolasi RNA Total Sel
Kit Isolasi RNA Total Tanaman Plus
Wektu kirim: Feb-10-2023