Sawise sarjana Amerika Eric S. Lander resmi ngusulake polimorfisme nukleotida tunggal (SNP) minangka penanda molekuler generasi katelu ing taun 1996, SNP wis akeh digunakake ing analisis asosiasi sipat ekonomi, konstruksi peta hubungan genetik biologis, lan screening gen patogen manungsa., Diagnosis lan prediksi risiko penyakit, screening obat individu, lan lapangan riset biologi lan medis liyane.Ing bidang pemuliaan potong kontan, deteksi SNP bisa nyadari seleksi awal sifat sing dibutuhake.Pilihan iki nduweni karakteristik akurasi sing dhuwur lan bisa kanthi efektif ngindhari gangguan morfologi lan faktor lingkungan, saengga bisa nyepetake proses breeding.Mulane, SNP nduweni peran gedhe ing bidang riset dhasar.

Polimorfisme Nukleotida Tunggal (Single Nucleotide Polymorphism, SNP) nuduhake fenomena sing ana beda nukleotida tunggal ing posisi sing padha ing urutan DNA individu saka spesies sing padha utawa beda.Penyisipan, pambusakan, konversi lan inversi saka basis siji bisa nyebabake prabédan iki.Ing jaman biyen, definisi SNP beda karo mutasi.Lokus varian mbutuhake frekuensi salah sawijining alel ing populasi luwih saka 1% supaya bisa ditetepake minangka lokus SNP.Nanging, kanthi ekspansi teori biologi modern lan aplikasi teknologi, frekuensi alel ora dadi syarat sing dibutuhake kanggo mbatesi definisi SNP.Miturut data variasi nukleotida tunggal sing kalebu ing basis data Polimorfisme Nukleotida Tunggal (dbSNP) ing Pusat Informasi Bioteknologi Nasional (NCBI), penyisipan / penghapusan frekuensi rendah, variasi mikrosatelit, lsp.

Ing awak manungsa, frekuensi SNP yaiku 0,1%.Ing tembung liyane, ana rata-rata siji situs SNP saben 1000 pasangan basa.Sanajan frekuensi kedadeyan kasebut relatif dhuwur, ora kabeh situs SNP bisa dadi tandha calon sing ana hubungane karo sifat.Iki utamane ana hubungane karo lokasi SNP.

Secara teoritis, SNP bisa kedadeyan ing ngendi wae ing urutan genom.SNP sing kedadeyan ing wilayah pengkodean bisa ngasilake mutasi sinonim lan mutasi non-sinonim, yaiku, asam amino owah utawa ora owah sadurunge lan sawise mutasi.Asam amino sing diganti biasane nyebabake rantai peptida ilang fungsi asline (mutasi missense), lan bisa uga nyebabake terjemahan gagal (mutasi omong kosong).SNP sing dumadi ing wilayah non-coding lan wilayah intergenik bisa nyebabake splicing mRNA, komposisi urutan RNA non-coding, lan efisiensi pengikat faktor transkripsi lan DNA.Hubungan khusus ditampilake ing gambar:

Tipe SNP:

Sawetara cara ngetik SNP umum lan perbandingan

Miturut prinsip sing beda-beda, metode deteksi SNP umum dipérang dadi kategori ing ngisor iki:

Klasifikasi perbandingan cara deteksi

Cathetan: Dhaptar ing tabel saiki digunakake cara deteksi SNP sing luwih umum, cara deteksi liyane kayata hibridisasi situs spesifik (ASH), ekstensi primer situs spesifik (ASPE), ekstensi basa tunggal (SBCE), pemotongan situs spesifik (ASC), teknologi chip gen, teknologi spektrometri massa, lan liya-liyane durung diklasifikasikake lan dibandhingake.

Biaya lan wektu pemurnian asam nukleat ing sawetara cara deteksi SNP umum ing ndhuwur ora bisa dihindari.Nanging, kit sing gegandhengan adhedhasar teknologi PCR langsung Foregene bisa langsung nindakake amplifikasi PCR utawa qPCR ing conto sing ora diresiki, sing ndadekake gampang kanggo deteksi SNP.

Produk seri PCR langsung Foregene kanthi prasaja lan kira-kira ngilangi langkah-langkah pemurnian sampel, sing nyuda wektu lan biaya sing dibutuhake kanggo nyiyapake template.Polimerase Taq unik nduweni kemampuan amplifikasi sing apik banget lan bisa ngidinke macem-macem inhibitor saka lingkungan amplifikasi kompleks.Karakteristik kasebut nyedhiyakake jaminan teknis kanggo entuk produk spesifik sing ngasilake dhuwur.Foregene Direct PCR / qPCR kit kanggo macem-macem jinis sampel, kayata: jaringan kewan (buntut tikus, zebrafish, lan liya-liyane), godhong tanduran, wiji (kalebu polisakarida lan conto polifenol), lsp.